Investigación
La Ley 16/1985 del Patrimonio Histórico Español concede a las comunidades autónomas las competencias y la gestión del Patrimonio de sus respectivos territorios. Bajo esta disposición legal, la Consejería de Cultura de nuestra Comunidad Autónoma desarrolló su propia normativa, que quedó finalmente recogida en la Ley 4/2007 de Patrimonio Cultural de la Región de Murcia, siendo la Dirección General de Bellas Artes y Bienes Culturales el organismo autonómico que tiene competencias en la materia.
Todas las intervenciones arqueológicas que se realizan en la Región han de contar con la oportuna autorización de la Dirección General de Bellas Artes, que determina, una vez concluidos los trabajos y hecha la clasificación y el inventario de los mismos, el museo donde quedarán depositados los materiales. El papel que los ayuntamientos tienen encomendado en la gestión del patrimonio de sus respectivos municipios, es el de cooperar con la Administración competente en la protección, promoción y difusión de tales bienes.
Como depositario de los materiales que proceden de las intervenciones realizadas en la ciudad y su término municipal, el Museo Arqueológico recibe cumplida información de los hallazgos que realizan los investigadores expresamente autorizados por la Dirección General de Bellas Artes y Bienes Culturales.Igualmente, se supervisan las actuaciones arqueológicas preventivas en aquellos lugares donde así lo disponen las normas urbanísticas de protección del casco histórico, generalmente en las zonas periféricas del recinto no sujetas a la obligatoriedad de la intervención.
Cueva Victoria (Estrecho de San Ginés). Yacimiento paleontológico de gran importancia, que alberga restos de fauna africana de hace más de un millón de años, y que cuenta con algunos restos óseos de homínidos de aquel tiempo, que se sitúan entre los más antiguos de Eurasia.
(Ladera meridional). Se trata de una amplia zona de excavaciones que discurre próxima a la calle Honda, paralela al decumano. Esta importante vía romana constituía el eje comercial más activo de Carhtago Nova, y los hallazgos que se vienen realizando dan buena cuenta de ello. En la actualidad existe un ambicioso proyecto de conservación de los restos que pronto permitirá unirlos a los del foro y la curia, en un mismo conjunto visitable
Villa Romana del Huerto del Paturro (Portmán). Una de las villas romanas más importantes de la comarca, que conserva numerosas trazas de las actividades industriales y artesanales que allí tuvieron lugar. En la actualidad se realizan simultáneamente tareas de excavación y consolidación.
P.A.U. Cartagena Oeste 1 (SUN CO-1)
Explotación porcina en Los Malagueños (La Aljorra)
Ampliación de la cantera del Corral (Paraje Coto de San Juan)
Gasoducto Cartagena-Agullent
Prospección subacuática entorno de Calblanque (Arqua)
Acometida línea eléctrica centro de transformación C/ Morería Baja.
Mejoras y acondicionamiento trazado carretera RM-320
Adarve del Castillo de la Concepción.
Plan Parcial Industrial CE-3 en Cabezo Beaza
Oleoducto Cartagena-Puertollano
Obras canalización y depósitos pluviales de tanques de tormentas en barrios norte y Rambla de Benipila
Además de exhibir las colecciones permanentes y aquellas de carácter temporal que llegan a su espacio, el museo cuenta con otras dependencias para almacenar, lavar, clasificar e inventariar los objetos que entran a formar parte de sus fondos, y que sirven de base para que los investigadores puedan desarrollar su actividad.
Atención al personal investigador:
El estudio y la publicación de los materiales que integran sus fondos son dos de los más importantes compromisos que el museo adquiere con la sociedad a la que sirve. La consulta de sus fondos se realiza por los investigadores de acreditada trayectoria, o por aquellos que se encuentran integrados en proyectos a cuyo frente se encuentre un investigador principal con tales requisitos. Para acceder a dichos materiales es necesario solicitarlo previamente mediante instancia en la que se expongan los motivos que justifican la consulta, el interés histórico que dicho estudio tiene, y el proyecto investigador en el que se inserta. Una vez aprobada por la Coordinadora Municipal de Arqueología (si se trata de fondos de titularidad municipal) o por el Director General de Bellas Artes y Bienes Culturales (si lo son de titularidad autonómica), los investigadores autorizados deberán cumplir los horarios y normas de acceso establecidas, comprometiéndose a la entrega de una copia de las memorias y publicaciones que de su estudio se generasen.
Investigaciones recientes de fondos del museo.
| Investigador responsable | Procedencia | Área | Especialidad | Materiales |
| Sebastián Ramallo | Univ. De Murcia | Arqueología | Elementos arquitectónicos | |
| Pedro Huertas | Universidad de Murcia | Tardorrepublicanos | ||
| Mª Ángeles Martínez | UNED | |||
| Michael Bode | Deutsches Bergbau-Museum | Arqueometalurgia | Lingotes plomo |